FID檢測器特別適合于有機化合物的常量到微量分析，是目前環保領域中，空氣和水中痕量有機化合物檢測的最好手段。抗污染能力強，檢測器壽命長，日常維護保養量也少，一般講FID檢測限操作在大于1×10-10 g/s時，操作條件無須特別注意均能正常工作，也不會對檢測器本身造成致命的損失。由于FID響應有一定的規律性，在復雜的混合物多組分的定量分析時，特別對于一般的常規分析，可以不用純化合物校正，簡化了操作，提高了工作效率。

FID檢測器是多用途的破壞性質量型通用檢測器，靈敏度高，線性范圍寬，廣泛應用于有機物的常量和微量檢測。其主要原理為，氫氣和空氣燃燒生成火焰，當有機化合物進入火焰時，由于離子化反應，生成比基流高幾個數量級的離子，在電場作用下，這些帶正電荷的離子和電子分別向負極和正極移動，形成離子流，此離子流經放大器放大后，可被檢測。

FID檢測器雖然是通用型檢測器，但有些物質在此檢測器上的響應值很小或無響應，這些物質包括永久氣體，鹵代硅烷，水，氨氣，一氧化碳，二氧化碳等等。所以，檢測這些物質的時候不宜使用FID檢測器。

FID檢測器是用氫氣和空氣中燃燒所產生的火焰使被測物質離子化的，所以要注意安全問題。在未接上色譜柱時，不要打開氫氣閥門，以免氫氣進入柱箱。測定流量時，一定不能讓氫氣和空氣混合，即測氫氣時要關閉空氣閥門，反之亦然。 FID檢測器的靈敏度與氫氣，空氣和氮氣的比例有直接關系，因此要注意優化。一般三者的比例應接近或等于1：10：1。另外有些儀器的設計有不同的噴嘴分別用于填充柱和毛細管柱，使用時要注意查看說明說。

為防止FID檢測器被污染，檢測器溫度設置不應低于色譜柱實際工作的最高溫度，一般應高于柱溫10—20 度，一旦檢測器檢測器被污染，輕則靈敏度明顯下降或噪聲增大，重則點不著火。消除污染的辦法是清洗，主要是清洗噴嘴表面和氣路管道。具體方法是拆下噴嘴，依次用不同極性的溶劑如丙酮氯仿和乙醇浸泡，并在超聲波水浴中超聲10min以上，還可以用細不銹鋼絲穿過噴嘴中間的孔，或用酒精燈燒掉噴嘴內的油狀物，以達到徹底清洗的目的。清洗之后將噴嘴烘干，再裝在檢測器上進行測定。