影響吹掃捕集測定結果的因素基本有兩個，一是吹掃-捕集進樣器本身，二是GC條件。前者包括解吸溫度、吹掃氣流速度、吹掃時間和解析條件等，故這些條件都應嚴格控制其重現性。而后者與普通GC相同。推薦用內標法或標準加入法進行定量，以減少操作條件波動對結果的影響。
在其他方面，如適當使用鹽化效應（加入NaCl），以增加萃取效率，但是在樣品分析之間必須做適當處理。
為使測定結果準確，采用吹掃捕集測定時，必須注意以下因素：
1>溫度
作為方法的一部分，可以放入一個磁力攪拌棒在吹掃階段進行攪拌，瓶子放置在加熱套中，使樣品達到期望的溫度。
其中有三個溫度需要控制：
（1）吹掃溫度，水溶液大多在室溫下吹掃，只要吹掃時間足夠長，就能滿足分析要求。升高溫度會增加水分的揮發。對非水溶液，溫度可以高些。
（2）捕集器溫度，包括吸附溫度和解吸溫度。吸附溫度常為室溫，但對不易吸附的氣體也可采用低溫冷凍捕集技術。解吸溫度是吹掃-捕集技術的重要參數，應依據待測組分的性質和吸附劑的性質來優化確定。商品化產品，最高可達450℃，但大部分環境分析的標準均采用200℃左右。
（3）連接管路的溫度，它應足夠高以防止樣品冷凝。環境分析常用的連接管溫度為80-150℃。
2>吹掃氣流速
吹掃氣流速取決于樣品中待測樣品的濃度、揮發性與樣品基質的相互作用（如溶解度）；以及其在捕集管中的吸附作用大小。用氦氣時，流速范圍為20～60mL/min,用氮氣時可以稍高一些，但氮氣的吹掃效果不及氦氣。原因是氮氣在水中的溶解度比氦氣大。注意，吹掃流速太大時會影響樣品的捕集，造成樣品組分的損失。
吹掃流量對測定結果也有不同的影響，隨吹掃流量的增大回收率有降低的趨勢，吹掃流量的設置結合其他因素選擇。
3>吹掃時間
原則上講，吹掃時間越長，分析重現性和靈敏度越高。但考慮到分析時間和工作效率，應在滿足分析要求的前提下，吹掃時間盡可能短。實際工作中可通過測定標準樣品的回收率（通常要求大于90%）。環境分析中吹掃時間一般為10min 左右。
4>解吸條件的選擇
解吸時的載氣流速主要取決于所用色譜柱。通常用填充柱時為30～40mL/min.用大口徑毛細管柱時為5-10mL/min。用毛細管柱時則要按分流或不分流模式來設置載氣流速。
解吸條件決定解吸效率，影響方法的回收率和穩定性，應通過試驗來確定最佳的解吸時間和最高的解析溫度。
解吸溫度的影響：解吸溫度過低，解吸緩慢并可能解吸不完全；解吸溫度過高，對吸附劑和目標化合物的穩定性均可能有一定影響
5>其他
（1）．適當使用鹽析效應（加入鹽溶液），以增加萃取效率，但是在兩個樣品分析之間，吹掃管和傳輸管線用清洗水清洗三次，可以大大減少腐蝕和鹽的沉積。
使用最大的樣品體積，可使檢測器能夠檢測到最大的樣品質量。（如大多數吹掃捕集方法都采用5ml的樣品，可以增加樣品體積到25ml，并且采用相應的過濾式吹掃管）。一般實驗結束后，所有玻璃容器需立即清洗，在105℃烘干備用。
（2）．應盡可能的除去所有的水，可以安裝除水裝置。
將樣品基質中所有揮發性組分都進行完全的“氣體提取”的方法，適合復雜基質中揮發性高的組分和濃度較低的組分分析。在冷肼捕集分析中水是對測定最大的影響因素，因為水在低溫時易結冰堵塞捕集器。
（3）．吹掃氣源：氦氣、氮氣純度應大于99.995%，壓力調節到30～100psi（207～1724kPa），并且連接到吹掃氣體入口。
氣體連接管：管道經過溶劑清洗并且烘焙過。溶劑最好是色譜級。樣品如為液體，可用攪拌和加熱以改善吹掃效率（加入一個磁力攪拌棒到VOA小瓶中）,且在轉移過程，盡量使泡沫最少。如檢測水樣，吹掃氣體中的雜質、捕集管中殘留的有機物及實驗室中溶劑蒸汽都有可能造成污染，避免使用聚四氟乙烯材料管路或含橡膠制品的流速控制器，同時用高純水進行空白分析，證明分析系統中沒有污染;如高濃度、低濃度水樣穿插分析時，每次分析后用高純水清洗吹掃器皿和進樣器兩次以上。
溶劑吹掃時間（也叫瞬間不分流時間和分流延遲時間）的確定依賴于樣品和溶劑的性質，襯管的容積、進樣量，進樣速度以及載氣流速等等因素的來確定。所以這一時間的確定應在以上所有條件都確定之后進行。
通常來說，溶劑吹掃時間增加的同時，其目標樣品的峰面積會逐漸增加，但吹掃時間到達一定時，氣相-液相平衡，增加吹掃時間將不增加峰面積的量，此時的吹掃時間即為極佳的吹掃時間設置值。