質譜儀圖上的離子類型是多種多樣的，主要可歸納為以下幾類：分子離子、同位素離子、碎片離子、重排離子、母離子~等，識別和了解這些離子的形成規律，對解析質譜儀十分重要。

1). 分子離子(molecular ion)

分子被電子束轟擊失去一個電子形成的離子稱為分子離子。分子離子用M+•表示。分子離子是一個游離基離子。在質譜圖上，分子離子對應的峰為分子離子峰。因此，分子離子的質量就是化合物的分子量，所以分子離子在化合物質譜的解釋中具有特別重要的意義。

分子離子峰的應用：

分子離子峰的質荷比就是化合物的相對分子質量，所以，用質譜法可測分子量。

2). 同位素離子(isotopic ion)

含有同位素的離子稱為同位素離子。大多數元素都是由具有一定自然豐度的同位素組成。這些元素形成化合物后，其同位素就以一定的豐度出現在化合物中。因此，化合物的質譜中就會有不同同位素形成的離子峰，在質譜圖上，與同位素離子相對應的峰稱為同位素離子峰。

3). 碎片離子(fragment ion)

分子離子在電離室中進一步發生鍵斷裂生成的離子稱為碎片離子。碎片離子是分子離子碎裂產生的。當然，碎片離子還可以進一步碎裂形成更小的離子。

4). 重排離子(rearrangemention)

經重排裂解產生的離子稱為重排離子。其結構并非原來分子的結構單元。

5) . 母離子(parent ion)與子離子(daughterion)

任何一離子進一步產生了某離子，前者稱為母離子，后者稱為子離子。分子離子是母離子的一個特例。

6 ). 奇電子離子與偶電子離子(odd-andeven-electron ion)

具有未配對電子的離子為奇電子離子。記為：M+. ，A+. …；奇電子離子也是自由基,具有較高的反應活性。無未配對電子的離子為偶電子離子。如：D+

7). 多電荷離子(multiply-chargedion)

失掉兩個以上電子的離子是多電荷離子。

8). 亞穩離子(meta-stable ion）

從離子源出口到檢測器之間產生的離子。

9). 準分子離子q(quasi-molecularion）

比分子量多或少1 質量單位的離子稱為準分子離子，如：(M+H) + 、( M-H)+；不含未配對電子，結構上比較穩定。

質譜圖解析的一般流程

一張化合物的質譜圖包含有很多的信息，根據使用者的要求，可以用來確定分子量、驗證某種結構、確認某元素的存在，也可以用來對完全未知的化合物進行結構鑒定。對于不同的情況解析方法和側重點不同。質譜圖一般的解析步驟如下：

(1)由質譜的高質量端確定分子離子峰，求出分子量，初步判斷化合物類型及是否含有CI、Br、S等元素。

(2)根據分子離子峰的高分辨數據，給出化合物的組成式。

(3)由組成式計算化合物的不飽和度，即確定化合物中環和雙鍵的數目。