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首頁-譜標服務-Orbitrap Fusion質譜儀蛋白質組學的應用

Orbitrap Fusion質譜儀蛋白質組學的應用

發布時間:2023-11-07       點擊次數:1179

蛋白質組學(Proteomics)是以蛋白質組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規律的科學。最早是1994年由Marc Wikins首先提出的。蛋白質組學本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征包括蛋白質的表達水平,翻譯后的修飾蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生,細胞代謝等生物學過程的系統描述。隨著蛋白質技術尤其是質譜技術的快速發展,蛋白質組學研究進入快速發展階段。蛋白質組學方法已經從傳統的免疫組織化學( IHC )染色、western blot和酶聯免疫吸附試驗( ELISA),發展到高通量的方法,如組織微陣列(TMA)、蛋白質通路陣列和質譜分析。這些高通量蛋白質組學技術不僅減少了分析時間,還提高了蛋白質組覆蓋的準確性和深度。隨著生物信息學和現代多分析“組學技術的發展,蛋白質組學在揭示疾病的分子機制,發現新的生物標志物方面有著巨大的前景,并可作為特定的診斷檢測、預后預測和治療目標,進一步加強個性化醫療。

Thermo Scientific Orbitrap Fusion Tribrid 質譜儀創新性的三合一結構結合了四極桿、Orbitrap和離子阱質譜儀的優點,對豐度極低、復雜性極高,或極難分析樣品的結構分析更透徹,定量更準確,非常適合蛋白質組學中復雜體系的高通量蛋白檢測,廣泛應用于蛋白組學、代謝組學和天然產物的鑒定等領域。

其中在蛋白組學的應用主要包括:

1、蛋白質定性分析:蛋白質序列分析,肽指紋圖譜分析等

2、相對定量蛋白質組學研究:血液、組織、細胞以及細菌等樣品的非標和標記定量蛋白質組學分析

質譜在蛋白質定量中起重要作用。使用同位素標簽的多重分析法被廣泛應用于蛋白質豐度的高通量定量比較。Orbitrap Fusion Lumos Tribrid三合一質譜儀可以執行同量異位素標記TMT,能夠以高定量精度同時分析10個樣品。Orbitrap Fusion Lumos具有高選擇性和更高的靈敏度,可實現最佳性能,同時可保持對低豐度分析物定量的高重現性。

3、翻譯后修飾(PTM)蛋白質組學研究:磷酸化、糖基化、甲基化、乙酰化等修飾位點的鑒定。

PTM在蛋白質組學中起著重要的作用,調節細胞活性定位,與其他細胞分子發生相互作用,如蛋白質、核酸、脂質和輔因子。Orbitrap Fusion Lumos Tribrid三合一質譜儀具有CID、HCD、ETD和EThcD等多個片段,可用于PTM分析,尤其是糖基化分析。例如,ETD和EThcD可以提供糖肽主鏈片段化的MS/MS譜圖,從而找到準確的修飾位點定位。

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