檢測低豐度分析物，在復雜樣品中

樣品越復雜，質譜系統越難對低豐度分析物進行鑒定和定量分析。SWATH采集技術由TripleTOF技術提供支持，可找到所有可檢測的物質，無論它們的濃度高低。

檢測復雜樣品中的低豐度化合物充滿挑戰，即使對于如今功能強大的MS分析儀來說也是如此。MS譜中的干擾會導致檢測低含量分析物面臨困難，即使使用高分辨率系統也無法解決問題。同時，高含量分析物會占用質譜儀的大量周期時間（MS/MS一般按強度順序采集），沒有時間捕捉與低含量分析物有關的MS/MS信息。要解決這個問題，需要在以下技術性能之間建立重要的相互關系：Q1采集窗口控制和在高速下保證MS/MS采集分辨率。

關鍵技術標準1：可變窗口采集

SCIEX 的SWATH 采集技術由可變窗口采集提供支持。通過使用可以調整 Q1 隔離窗大小的控件，您可以在樣品密度高的 m/z 區域（預期有大數量的化合物和分析物的區域）利用更小的Q1 m/z 窗口。這樣一來，專一性會更高，從而能夠捕捉與樣品相關的更深入信息，降低漏掉復雜樣品中低豐度峰的風險。

以蛋白質組學樣品為例
大量肽的質量范圍介于500-800 m/z 之間。使用可變窗口采集，您可以在此質量范圍內利用更小的 Q1 SWATH 窗口（在此密集樣品區域中覆蓋更多的峰），然后在其他質量范圍內使用更寬的窗口。總之，此策略可為您提供全面的分析物覆蓋，并且可以進一步檢測樣品中的低豐度化合物。

關鍵技術標準2：在高速下保證MS/MS分辨率

如前所述，復雜樣品會占用質譜儀寶貴的掃描時間，導致系統只能有足夠的時間捕捉樣品中含量更多的分析物的 MS/MS 信息，而這些分析物可能并不是您要分析的物質。在利用數據依賴型采集策略時，低豐度化合物中檢測的峰甚至可能不會觸發 MS/MS 采集，而這種采集對化合物鑒定至關重要。

借助 TripleTOF6600 和 SWATH采集技術，每秒多可采集 100 張 MS/MS 譜圖，同時不會降低光譜分辨率，從而提供更高數量的 Q1 窗口。這樣不僅可以更好地檢測低含量分析物，重要的是，還可以利用每份樣品完成更多的化合物鑒定和定量分析。

首次分析時可捕捉樣品完整的數字檔案

停止儲存樣品，開始儲存數據。只需分析一次，SWATH采集技術就可以收集所需要的與樣品相關的所有數據。如果分析事件至關重要、無法重復分析、樣品數據有限或樣品可能會講解，這種技術的優勢就更為明顯。

作為非數據依賴型采集策略，SWATH采集技術可以在所有可檢測峰上采集MS和MS/MS信息—如果以后出現新問題，只需重新查詢樣品數據即可。

對分析物進行定量分析

高質量、高專一性定量分析的核心在于出色的MS/MS靈敏度、寬動態范圍和非凡重現性。SWATH采集技術采用SCIEX TripleTOF技術，可提供上述三種優勢。

通常，不僅僅是樣品的成分十分重要，樣品中成分的"含量"對我們得出的結論或制定決策也很關鍵。SWATH采集技術是一種非數據依賴型策略，擁有其他技術所不具備的功能。從使用高分辨率MS/MS數據（通過MS）提供深度高一個數量級的定量覆蓋，到經過驗證的樣品間重現性，SWATH采集可以提供可靠的定量結果，從而推進研究，達到標準的MRM定量分析策略水平。